Использовать ККТ можно только по месту ее «прописки»
28 сентября 2015
Если организация ведет торговлю через обособленные подразделения, находящиеся в одном муниципальном образовании, но относящиеся к разным ИФНС, то применять в каждом из ОП можно лишь ту контрольно-кассовую технику, которая зарегистрирована по месту нахождения именно этого подразделения.
Источник: Постановление ВС РФ от 11.08.15 № 302-АД15-3955 
Судебные инстанции, в т.ч. Верховный суд, считают, что применение ККТ не по месту «прописки» равнозначно неприменению кассовой техники и влечет соответствующие штрафные санкции - для организаций размер наказания составляет от 30 до 40 тысяч рублей 
.
Правда, если деятельность вы ведете в Москве или Санкт-Петербурге, то штрафы вам не грозят. Ведь в ККТ-регламенте четко прописано, что в подобной ситуации кассовый аппарат регистрируется в ИФНС по месту учета любого из ОП, расположенных на территории одного муниципального образования, по выбору плательщика
